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Análise Cladística

Aula 4 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"

por Eduardo Andrade Botelho de Almeida

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Sobre a aula

Congruência de caracteres e maximização das hipóteses de homologia (implícitas nos caracteres e seus estados) na seleção da árvore mais parcimoniosa. Parcimônia como critério de otimalidade para seleção de hipóteses filogenéticas. Introdução ao algoritmo de Fitch para otimização de caracteres discretos (apenas passagem descendente).

Disciplina

5920885-2 Análise Cladística

EMENTA

Programa: Aplicação de conceitos gerais da sistemática filogenética: hierarquia da informação biológica (homologias, apomorfias, plesiomorfias etc.); critérios de otimalidade: parcimônia, máxima verossimilhança e probabilidade posterior bayesiana; cladogramas e outros grafos filogenéticos, grupos monofiléticos e não-monofiléticos, comunicação filogenética e educação com cladogramas; amostragem taxonômica; construção e codificação de caracteres e natureza da informação biológica: tratamento de caracteres morfológicos, moleculares, genéticos, comportamentais e ecológicos; classes de caracteres (binários, multiestados, ordenados ou aditivos vs. não-ordenados ou não-aditivos); pesagem de caracteres; enraizamento de cladogramas; consensos de árvores; mapeamento e otimização de caracteres; avaliação de suporte de ramos e estabilidade das árvores; aplicações filogenéticas: evolução de características fenotípicas e evolução molecular; apresentação de resultados.

Objetivo

Geral: Fornecer o instrumental para o desenvolvimento de análises filogenéticas; desenvolver e estimular a capacidade de reflexão sobre quais os recursos a serem empregados para efetuar análises, assim como sobre o potencial deste instrumental para apreciação de relações de parentesco entre táxons, biogeografia, evolução molecular e fenotípica. A disciplina proverá a base necessária para atividades fundamentais na prática de estudos filogenéticos, como a construir matrizes de dados e efetuar análises filogenéticas.

Específico: Após a disciplina, o aluno deverá compreender os recursos de cada metodologia de análise cladística, suas limitações e recursos; ser capaz de elaborar matrizes de dados e efetuar análises cladísticas básicas; compreender o procedimento de polarização de caracteres e de enraizamento de árvores; compreender a lógica subjacente da conexão (“ordenação”) entre estados de caracteres e da pesagem dos mesmos; compreender a lógica dos métodos bayesianos e de máxima verossimilhança; conhecer os principais programas de cladísticas e seus recursos fundamentais.

Índice de vídeos da disciplina

  1. Aula 1 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  2. Aula 2 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  3. Aula 3 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  4. Aula 4 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  5. Aula 5 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  6. Aula 6 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  7. Aula 7 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística" (participação especial do Dr. Danilo Ament)
  8. Aula 8 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  9. Aula 9 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  10. Aula 10 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  11. Aula 11 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  12. Aula 12 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  13. Aula 13 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  14. Aula 14 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística"
  15. Complemento à aula 14 da disciplina 5920885 - "Análise Cladística" (Instruções sobre o Trabalho Final)
Pró-Reitoria de Graduação
Telefone: +55 11 3091-9942