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Introdução à Bioinformática: Acessando Bancos de Dados Primários

por Elisabete Jose Vicente

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Sobre a aula

Este video tem como objetivo ensinar como acessar dados dos Bancos de dados de bioinformática primários que contem sequencias de nucleotídeos (genes) e de aminoácidos (proteínas): NCBI (americano), EMBL (europeu) e DDBJ (japonês).

Disciplina

BMM0180-1 Micro-organismos em Biotecnologia

EMENTA

1
AULAS TEÓRICAS 1A. Filogenia dos Seres Vivos. Diversidade Microbiana: Escopo, Dimensão e Aplicações.1B. Morfologia da célula bacteriana.
AULAS PRÁTICAS - Visualização de bactérias coradas por Gram ao microscopio óptico.
2
AULAS TEÓRICAS 2A. A Biotecnologia tradicional e a Biotecnologia do século 21. 2B. Cultivo de Micro-organismos.
AULAS PRÁTICAS - Coloração de Gram - Cultivo de bactérias
3
AULAS TEÓRICAS 3A. Controle Microbiano. 3B. Genética bacteriana.
AULAS PRÁTICAS - Ação de desinfetantes - Visita setor esterilização
4
AULAS TEÓRICAS 4. Exemplos de emprego de micro-organismos em processos Biotecnológicos industriais: - Indústria de Alimentos: Produção de alimentos (pães, queijos, fermentados, embutidos), Produção de bebidas, Single Cell Protein e Suplementos derivados, Produção de Aromas e essências, Produção de Aditivos para alimentos (conservantes naturais, emulsificantes, espessantes), Alimentos funcionais (Nutracêuticos), Prebióticos e probióticos.
AULAS PRÁTICAS -Isolamento de bactérias de alimentos
5
AULAS TEÓRICAS - Indústria Farmacêutica: Compostos farmacologicamente ativos, Antimicrobianos: antibióticos e antivirais, Diagnostico de doenças; Vitaminas, hormônios, vacinas, Biopolímeros de aplicação médica (ex: pele artificial), Fagoterapia.
AULAS PRÁTICAS – Antibiograma – MIC - Isolamento de fagos e Visualização de placas de lise (1)
6
AULAS TEÓRICAS - Agroindústria: Controle biológico de insetos e patógenos, antiparasitários, Fixação biológica de nitrogênio, Aumento de fertilidade do solo (Compostagem e tratamento biológico de resíduos), Promotores de crescimento de plantas, Promotores de crescimento animal.
AULAS PRÁTICAS - Leitura de práticas anteriores - Isolamento de bactérias de solo contaminado (1)
7
AULAS TEÓRICAS - Indústria Química: Produção de Matérias-primas industriais diversas (Biotransformações em química fina): Polissacarídeos, Biopolímeros, Biosurfactantes, Ácidos orgânicos,
Aminoácidos. Enzimas de aplicação industrial, para: Detergentes, têxteis, papel e celulose.
Assimilação de metano e enxofre em processos industriais.
AULAS PRÁTICAS - Continuação de práticas anteriores. Acompanhamento da Produção de etanol em provetas. Analise das leveduras ao M.O.
8
AULAS TEÓRICAS - Ambiental: Biorremediação de resíduos tóxicos recalcitrantes, Recuperação de áreas degradadas,Biorremediação de vazamentos de petróleo, Micorrizas e bactérias fixadoras de nitrogênio, Biomineração/Biolixiviação, Biosensores (monitoramento de poluentes).
AULAS PRÁTICAS - Isolamento de bactérias de solo contaminado (2)
9
AULAS TEÓRICAS - Energia: geração de combustíveis: Bioetanol, Biodiesel.
AULAS PRÁTICAS - Isolamento de bactérias de solo contaminado (3)
10
AULAS TEÓRICAS 4. Bioinformática e informática para análise da biodiversidade, como uma ferramenta para a integração de dados.
AULAS PRÁTICAS - Laboratório de bioinformática: Apresentação de bancos de dados
Alinhamento de duas sequencias
11.
AULAS TEÓRICAS 5.Genômica funcional: chave para novas descobertas e aplicações.
AULAS PRÁTICAS -Laboratório de bioinformática: Alinhamento de duas sequencias (continuação). - Distribuição de Temas para o Trabalho. Orientação.
12.
AULAS TEÓRICAS 6. Metagenoma: exploração do potencial biotecnológico de organismos não-cultivados.
13.
AULAS TEÓRICAS 7. Bactérias geneticamente modificadas em Biotecnologia: Regulação da expressão genica em procariotos, Construção de recombinantes bacterianos, Exemplos de produtos.
14
AULAS TEÓRICAS 8. Leveduras geneticamente modificadas em Biotecnologia: Regulação da expressão genica em eucariotos, Construção de recombinantes de leveduras, Exemplos de produtos.
15
9. DISCUSSÃO FINAL: Analise de Perspectivas para o levantamento das Tecnologias e das Estratégias para bioprospecção, seleção e triagem de micro-organismos de interesse industrial.
16
Avaliação Final
32+4=36 h (aulas teoricas) /24 h (aulas práticas)
total= 60 h ( 4 créditos)

Objetivo

Ensino da microbiologia voltada para emprego em Biotecnologia.

Índice de vídeos da disciplina

  1. Introdução à Bioinformática: Acessando Bancos de Dados Primários
Superintendência de Tecnologia da Informação