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Sobre a aula
Aula 12: Método Monte Carlo:
* Amostragem de Metropolis; e
* Detalhes de implementação: tamanho e formato da caixa, condição de contorno, raio de corte e correção de longo alcance.
Slides disponíveis no site: http://portal.if.usp.br/gfmm/pt-br/kaline-disciplinapos
Disciplina
EMENTA
1. Propriedades de líquidos.
2. Modelo para o potencial de interação intra e intermolecular.
3. Mecânica estatística de líquidos.
4. Método de Dinâmica Molecular.
5. Método Monte Carlo.
6. Técnicas avançadas: cálculo de energia livre, amostragem preferencial, entre outras.
7. Aplicação de simulações computacionais com método Monte Carlo e Dinâmica Molecular em sistemas modelo e realistas.
8. Análise de resultados: propriedades termodinâmicas, propriedades estruturais, erros, correções de resultados, entre outras.
Objetivo
Neste curso serão apresentadas as técnicas tradicionais de simulação de sistemas moleculares (Dinâmica Molecular e Monte Carlo), os conceitos fundamentais de mecânica estatística, os algoritmos eficientes, técnicas avançadas de simulação e procedimentos de análise de resultados. Adicionalmente, serão desenvolvidos e/ou manuseados programas para a realização de aplicações práticas de simulações computacionais de líquidos moleculares.
Índice de vídeos da disciplina
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 01: Introdução (parte 1)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 02: Introdução (parte 2)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 03: Tutorial do programa Gaussian
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 04: Campo de força clássico (parte 1)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 05: Campo de força clássico (parte 2)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 06: Campo de força clássico (parte 3)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 07: Mecânica estatística de líquidos (parte 1)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 08: Mecânica estatística de líquidos (parte 2)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 09: Tutorial programa DICE
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 10: Tutorial do programa ORDER
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 11: Método Monte Carlo (parte 1)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 12: Método Monte Carlo (parte 3)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 13: Método Monte Carlo (parte 3)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 14: Tutorial programa DICE (flexível)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 15: Dinâmica Molecular (parte 1)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 16: Dinâmica Molecular (parte 2)
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 17: Dinâmica Molecular (parte 3)
- PGF5216 Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 18: Apresentação do programa GROMACS
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 19: Raio de corte, Lista de vizinhos e Correções de longo alcance
- PGF5216 – Simulação Computacional de Líquidos Moleculares - Aula 20: Iniciando simulações com o programa GROMACS