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Sobre a aula

Aula 2: aula prática sobre NGS para ser desenvolvida durante a aula. Esta aula é de autoria do Dr Marcelo Candido.

Disciplina

VPS5708-10 Fundamentos em Sorologia, Diagnóstico Molecular e Filogenias Moleculares Aplicados à Detecção e Identificação de Patógenos Transmissíveis

EMENTA

A disciplina será oferecida em 12 horas semanais, durante cinco semanas. Na primeira semana serão apresentados conceitos em acurácia e desempenho de provas diagnósticas como sensibilidade, especificidade, valores preditivos positivos e negativos e razão entre probabilidades. Também neste período serão desenvolvidos conhecimentos em testes de concordância entre provas diagnósticas: estatísticas Kappa, McNemar e respectivos intervalos de confiança. Na segunda semana, serão abordados os métodos sorológicos e suas particularidades analíticas: sorodiagnóstico, identificação sorológica, testes de ligação primária e secundária, métodos imunocromatográficos, métodos imunoenzimáticos, imunofluorescência direta e indireta, títulos e pontos de corte, conceitos de antígenos e determinantes antigênicos e suas respectivas implicações no desempenho da prova diagnóstica. Métodos moleculares, com ênfase na reação em cadeia pela polimerase e sequenciamento direto de nucleotídeos por método de Sanger serão abordados na terceira semana com atividades em desenho de primers, conceitos em marcadores moleculares para diagnóstico e uso de ferramentas básicas em bioinformática. Na quarta semana serão ministrados fundamentos em filogenias moleculares e estudos de genética populacional com enfase em aplicações para epidemiologia molecular. A quinta e última semana será reservada para a apresentação de seminários, por meio de referatas de artigos científicos apresentadas pelos estudantes.

Objetivo

Desenvolver e estimular a capacidade de avaliação crítica de resultados de provas diagnósticas para infecções causadas por agentes transmissíveis empregadas em estudos clínicos e epidemiológicos.

Índice de vídeos da disciplina

  1. Explicando o método de citometria de fluxo
  2. Explicando o método de Sanger para sequenciamento automático de DNA
  3. Métodos de inferência filogenética: parcimônia e distância
  4. Obtendo sequências gênicas com o método de Sanger
  5. Biomol 1
  6. Biomol 2
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